阿克苏绿洲农田生态系统国家野外研究站位于新疆阿拉尔市,距乌鲁木齐市1100公里,距阿克苏市80公里,地理坐标为东经80°51′,北纬40°37′,海拔1028 m,位于塔里木河三大源流(阿克苏河、叶尔羌河、和田河)交汇点附近的平原荒漠—绿洲区内,该区域是国家重要的优质棉基地。